広大なハイラル各地に謎の裂け目が生まれ、人や物を飲みこむ「神隠し」が発生。
剣士リンクもこれに飲みこまれて行方不明に。
残されたゼルダ姫は民やリンクを救うため、ハイラルを巡る冒険へと旅立ちます。

今作の主人公はなんとゼルダ姫。
妖精の「トリィ」と出会い、ともにハイラルを旅することとなります。

ゼルダ姫はトリィから、「トリィロッド」と呼ばれる不思議な杖を授かります。
この杖の力で、テーブル、木箱、ベッドなど、ハイラルのさまざまなものをお借りできる「カリモノ」の力が使えるようになります。

一度借りたものは、いつでもどこにでも作り出すことが可能。
例えば、テーブルを作り出して段差を作れば、行く手を阻む崖を飛び越えることができます。

ハイラルに巣食う魔物たちとのバトルでも、カリモノを活用します。
石などのカリモノを出現させ、投げつけて戦うこともできますが、なんと魔物までも「カリモノ」にすることができ、ゼルダ姫の代わりに戦ってくれます。

状況や相性を判断してどの魔物を向かわせるかなど、バトルでも知恵を活かした戦略がカギとなります。
またバトル以外にも、空飛ぶ魔物の力を借りて滑空したり、炎の魔物に草木を燃やしてもらったりと、ゼルダ姫の冒険をサポートしてくれることも。